近代以来，“科学”作为一种发现真理的手段，在中国取得绝对的胜利，并演化为一切真理的标准，形成话语霸权，“不科学”就等于绝对谬误。这是对科学的盲信，科学本身并不是真理，只是寻求真理的手段。100年来关于废除中医、消灭中医的争论，其核心就在“科学”这两个字上。说中医不是科学，不科学就要被取缔！现在，一些中医从业者也听不得“中医不科学”这样的评价，这也说明对中医自身对自己的文化缺乏自信。
中医不是现代科学定义下的知识体系
关于科学定义有很多，但最核心的要素是以物质为研究对象，以实验方法为基础，对客观物质进行规律性研究的系统行为，即：发现物质本源，发现物质运动规律，才是现代科学的定义。中医不是现代科学定义下的知识体系，虽说它也是对宇宙间事物规律进行研究，但缺乏“客观物质”这样一个基本要素。中医的整个知识体系是一个虚拟的功能系统。以“气一元论”为根基的物质范畴和“天人相应”的世界观，以人体生理功能集合进行分类的脏象理论，模拟自然现象的六淫病理，辨证论治的思想方法，“医者意也”“运用之妙存乎一心”的临床思维模式……中医知识体系的研究对象很多不是客观物质，而是对客观物质进行模拟后得出的规律性概念（如五脏功能系统），大部分的中医理论也无法用实验的方式来证实或证伪。因此，中医学确实存在不符合现代科学本质的内容，无法纳入现代科学知识体系范围。
尽管中医理论是“立象以尽意”的思辨结果，但是古代中医以尖锐的目光，将客观存在的现象进行主观的归纳和总结，形成的理论又直接指导着方法技术的运用，对象则是真实的人，因此，其知识体系必然蕴含大量科学发现和无穷的未知真理，是现代科学研究的基因、素材。
现代人的知识结构已经完全被西方科学文化所占据，中医理论已经成为隐性知识。直观、还原的思维方式，无法领略灵活悟性的古代思维。例如，中医“天人合一”理论的核心价值是人和自然的和谐，但时代限，其中也有“天有日月，人有两目。地有九州，人有九窍。天有风雨，人有喜怒……”这样的无稽类比怎么认识？
中医知识体系中还有很多这样的东西，现代人根本无法接受。所以，古代中医理论不整理、不研究，人们就无法认识它、接受它，中医就失去了发展根基。中医理论很多是思辨的结果，有很多缺陷，而古代中医唯一的证伪方式就是经验。以现代眼光看，凡是经过经验验证的，往往蕴涵着真理；凡未经经验验证的纯思辨知识，则往往是虚妄的。
怎样运用科学技术发展中医
今天，我们用来证伪的武器除了传统的经验之外，还有科学。用科学来研究中医，是时代必然，但也导致一些问题，这是东西方文化在指导思想、认知方式、价值取向上的差异所致。如果不能解决这一基本问题，则会出现荒谬的结果，不仅对发展中医无益，甚至有害。例如，同样的研究指标，现有评价体系只认实验室里的动物而不认诊室里的人，推拿治疗小儿消化不良，同样的检测非要在兔子身上再做一遍，才承认这是“科研”。
现代医学和中医学有很多不同，包含着不同切入点：现代医学是以科学为基础的病因学治疗，而以中国传统文化为基础的中医学是发病学治疗，这两者有不同的发展方向。科学首先要弄明白中医知识中哪些是能够证明的客观事物（经验的东西一定可以采用实验方法的），哪些是无法实验的认识论、方法论等社会哲学思想，怎么搭建发现中医隐性知识和潜在真理的符码平台，而不是去做那些没有意义的实验（例如寻找三焦的本质——三焦是人为划分人体部位的概念）。
总之，中医文化价值给人以智慧的启迪。首先，中医给我们带来不需要实验的认知方式，这在科学尚不能完全解决人类所有问题的今天，不啻于人类认识世界的另一种方式。其次，中医带给我们客观实用的价值取向，为人类健康和疾病防治提供了另一类判定标准，如带瘤生存。再次，中医还带给我们全新的医学理念，是人类医学知识体系中不可或缺的一部分，例如“治未病”，防治结合，治养结合。最后，中医带给我们无数的技术方法和药物，这些经过千百年实践检验的措施可以大大填补现代医学的不足。
（作者为南京中医药大学教授）